De
los conflictos más difíciles que le ha tocado enfrentar
a la CT-UNAH, en sus casi dos años de funcionamiento, destacan
el complot para boicotear la reforma, la confrontación
con el ex rector Guillermo Pérez Cadalso, que luego lleva
a su dimisión y nombramiento de otra autoridad, y el conflicto
y la división interna dentro del mismo organismo.